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產(chǎn)品關(guān)鍵詞:深圳病毒序列測序分析方法,病毒全基因組測序
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在的鑒定及診斷中,通過高通量測序技術(shù)和RT-PCR方法的聯(lián)合使用,可以實現(xiàn)優(yōu)勢互補,提高陽性檢出率。更為重要的是,利用高通量測序技術(shù)還可以對病毒序列進行組裝,獲得病毒全長基因組信息,為監(jiān)測病毒變異、探究致病機理提供研究基礎(chǔ)。本次報告將圍繞高通量測序技術(shù)在**檢測中的方法和策略展開分享。高通量測序技術(shù)的飛速發(fā)展使其在病毒學(xué)研究領(lǐng)域得到了越來越普遍的應(yīng)用,深圳病毒序列測序分析方法。無論是突發(fā)**的應(yīng)急處理、新病毒的發(fā)現(xiàn),還是較大規(guī)模的分子流行病調(diào)查,深圳病毒序列測序分析方法,深圳病毒序列測序分析方法,高通量測序技術(shù)都比一代測序技術(shù)有著巨大的優(yōu)勢。SFTS病毒(SFTSvirus,SFTSV)是2009年在中國新發(fā)現(xiàn)的一種布尼亞科白蛉病毒屬的蜱傳病毒,為新發(fā)傳染病發(fā)熱伴血小板減少綜合征(Severe fever with thrombocytopenia syndrome,SFTS)致病病因,現(xiàn)在在中國至少20個省流行。探普生物對病毒的全基因組進行測序的實驗基于二代測序技術(shù)。深圳病毒序列測序分析方法
在哪些應(yīng)用場景需要對病毒的全基因組進行測序?在探普生物長時間運行過程中,我們接觸到的對病毒的全基因組進行測序項目有比較豐富的應(yīng)用場景。先,從事基因進化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會用到測序。這種場景一般是用密集的sanger測序監(jiān)測某幾個關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測序。這樣的組合省時省力省經(jīng)費,同時能達到研究目的。此外,有的單位需要對傳染病的病原進行流行病學(xué)監(jiān)測和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對病毒的全基因組進行測序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達到研究或者監(jiān)測疫病的目的。深圳病毒序列測序分析方法病毒全基因組測序產(chǎn)品特點:整體檢出率陽性率較傳統(tǒng)方法提升25~30%。
新一代測序中,基因從頭測序和重測序有什么區(qū)別?我要做乙肝病毒DNA全長測序,應(yīng)該選用哪種方法?1、條件不同;從頭測序的條件是不依賴于任何物種基因組;重測序的條件是在已知物種基因組的情況下進行的。2、病毒變異率不同;從頭測序是通過拼接和組裝的方式獲得基因組序列圖譜,病毒變異率很低;重測序可以尋找出大量的單核苷酸多態(tài)性位點,插入缺失位點,結(jié)構(gòu)變異位點,拷貝數(shù)變異等變異信息,從而獲得生物群體的遺傳特征。病毒變異率很高。乙肝病毒在醫(yī)學(xué)上已經(jīng)測過,只需要做重測序就可以。
測序深度,測序得到的堿基總量(bp)與基因組大?。℅enome)的比值,它是評價測序量的指標(biāo)之一。測序深度(Sequencing Depth):測序得到的堿基總量(bp)與基因組大?。℅enome)的比值,它是評價測序量的指標(biāo)之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關(guān)的關(guān)系,測序帶來的錯誤率或假陽性結(jié)果會隨著測序深度的提升而下降。重測序的個體,如果采用的是雙末端或Mate-Pair方案,當(dāng)測序深度在10~15X以上時,基因組覆蓋度和測序錯誤率控制均得以保證。比較基因組學(xué)層面可通過差異分析、同源基因分析、共線性分析、物種進化分析等手段探究病毒的毒力系統(tǒng)。
深度測序技術(shù)對社會的影響:深度測序技術(shù)促進了基因檢測的普及,對社會的影響第1個方面反映在商業(yè)模式的變化,即醫(yī)學(xué)檢驗和健康管理方面的平民化、個性化趨勢的形成。社會生活受到深度測序技術(shù)影響的第二個方面是基因測序的普遍應(yīng)用。例如,基因關(guān)聯(lián)將人與人通過遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)起來,人們可以對基因進行分析判定親緣關(guān)系,基因測定甚至可以幫助判定婚姻(包括遺傳病等方面的)匹配度。公安機關(guān)可以通過基因比對,鎖定犯罪嫌疑人、尋找丟散的兒童和親人。甚至有報道表明,測定20多個基因就可以將人臉重構(gòu)。基因檢測的應(yīng)用將隨著基因-表型的關(guān)聯(lián)得到更普遍的應(yīng)用,對社會生活的方方面面起到重要作用。病毒的全基因組測序以及對應(yīng)的生物信息學(xué)分析方法是研究病毒進化、毒力因子變異、疫病爆發(fā)之間的關(guān)系。成都病毒全序列服務(wù)公司
全基因組測序覆蓋面廣,能檢測個體基因組中的全部遺傳信息,準(zhǔn)確性高。深圳病毒序列測序分析方法
病毒全基因組測序產(chǎn)品特點:1.不預(yù)設(shè)目標(biāo)檢出物,樣本的所有病原信息一網(wǎng)打盡;2.無需培養(yǎng)和特異性擴增,對采集臨床樣本直接檢測;3.獨有的一定定量技術(shù),實現(xiàn)病原定量分析,使病原診斷更準(zhǔn)確;4.與臨床各領(lǐng)域****共同打造呼吸道系統(tǒng)、神經(jīng)內(nèi)科系統(tǒng)和血流系統(tǒng)傳染病原數(shù)據(jù)庫,更加貼合需求;5.采用高通量測序儀,全流程質(zhì)控, 結(jié)果穩(wěn)定可靠;6.整體檢出率陽性率較傳統(tǒng)方法提升25~30%:肺泡灌洗液檢出率60~80%,腦脊液檢出率40~60%,血液檢出率40~60%;7.專業(yè)化服務(wù):臨床微生物**出具報告,專業(yè)醫(yī)學(xué)團隊報告解讀。針對疑難報告,由****進行深度解析 ;8.完善的售后服務(wù):基于PCR技術(shù)和抗原抗體技術(shù)的售后驗證平臺,致力于解決臨床的每一個疑問。深圳病毒序列測序分析方法
上海探普生物科技有限公司位于放鶴路1088號6號樓307,交通便利,環(huán)境優(yōu)美,是一家服務(wù)型企業(yè)。是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè),隨著市場的發(fā)展和生產(chǎn)的需求,與多家企業(yè)合作研究,在原有產(chǎn)品的基礎(chǔ)上經(jīng)過不斷改進,追求新型,在強化內(nèi)部管理,完善結(jié)構(gòu)調(diào)整的同時,良好的質(zhì)量、合理的價格、完善的服務(wù),在業(yè)界受到寬泛好評。公司擁有專業(yè)的技術(shù)團隊,具有病毒測序,病毒全基因組測序,病毒宏基因組測序,未知病原鑒定等多項業(yè)務(wù)。上海探普生物以創(chuàng)造***產(chǎn)品及服務(wù)的理念,打造高指標(biāo)的服務(wù),引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展。
文章來源地址: http://www.cdcfah.com/cp/2631203.html
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