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詳細(xì)說(shuō)明
產(chǎn)生的 ΔRn 值也不同。請(qǐng)注意,北京MiRNA 熒光定量PCR分析服務(wù),熒光信號(hào)基線屬于非模板依賴性因素,兩種預(yù)混液的基線是不同的(圖 3A)。Ct 值的變化并沒(méi)有反映出反應(yīng)系統(tǒng)的整體性能(圖 3B)。靈敏度相當(dāng)?shù)念A(yù)混液產(chǎn)生的 Ct ***值可能不同,北京MiRNA 熒光定量PCR分析服務(wù)。
使用預(yù)混液 A 和預(yù)混液 B 在等量的人類 gDNA 中進(jìn)行 RNase P 擴(kuò)增。(A) Rn 根據(jù)循環(huán)數(shù)進(jìn)行繪制,并且顯示兩個(gè)反應(yīng)的基線。(B) 對(duì)數(shù) (ΔRn) 根據(jù)循環(huán)數(shù)進(jìn)行繪制。兩種預(yù)混液的閾值(綠線)設(shè)定為相同水平。對(duì)于相同濃度的靶標(biāo)而言,預(yù)混液 B 的 Ct 值 (CtB) 早于預(yù)混液 A 的相應(yīng)值 (CtA),北京MiRNA 熒光定量PCR分析服務(wù),表明預(yù)混液 B 的基線較低。使用 Applied Biosystems? 7500 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 系統(tǒng)執(zhí)行所有擴(kuò)增。
一個(gè)評(píng)估 PCR 效率的關(guān)鍵參數(shù)是 R2,它是說(shuō)明如何使用一個(gè)數(shù)值預(yù)測(cè)另一個(gè)數(shù)值的相關(guān)程度的統(tǒng)計(jì)學(xué)術(shù)語(yǔ)。如果 R2 為 1,那么 Y 值 (Ct) 可以用來(lái)準(zhǔn)確預(yù)測(cè) X 值(圖7A)。如果 R2 為 0,那么就不能通過(guò) Y 值預(yù)測(cè) X 值(圖 7B)。R2 值 >0.99 表示兩個(gè)數(shù)值之間相關(guān)的置信度良好。
精確度
標(biāo)準(zhǔn)差(偏差的平方根)是**常用的精確度計(jì)量方法。如果許多數(shù)據(jù)點(diǎn)都靠**均值,則標(biāo)準(zhǔn)差就??;如果許多數(shù)據(jù)點(diǎn)都遠(yuǎn)離平均值,則標(biāo)準(zhǔn)差就大。
實(shí)際上,足夠多重復(fù)次數(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)**形成大致的正態(tài)分布。這經(jīng)??赏ㄟ^(guò)經(jīng)典的中心極限定理來(lái)證明,該定理稱大量**同分布隨機(jī)變量的和在無(wú)限多時(shí)趨向于正態(tài)分布。如圖 8A 所示,約 68% 的值在平均值的 1 個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差之內(nèi),約 95% 的值在平均值的 2 個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差之內(nèi),約 99.7% 的值在平均值的 3 個(gè)標(biāo)準(zhǔn)差之內(nèi)。
無(wú)論 Ct ***值是多少,任何能夠有效擴(kuò)增和檢測(cè)起始模板拷貝數(shù)為 1 的系統(tǒng)都達(dá)到了靈敏度的極限。
如前文所述,效率是決定反應(yīng)靈敏度的關(guān)鍵因素(圖 5)。在檢測(cè)極低拷貝數(shù)時(shí)的另一個(gè)重要的考慮因素是,不能預(yù)期模板為正態(tài)分布。相反,它會(huì)遵循泊松分布,該分布預(yù)測(cè)在平均包含一個(gè)拷貝的起始模板的大量重復(fù)中,實(shí)際上約 37% 不含拷貝,*有約 37% 含有 1 個(gè)拷貝,18% 應(yīng)包含 2 個(gè)拷貝(見(jiàn)圖 9)。因此,為了可靠地檢測(cè)低拷貝,必須做大量的重復(fù)實(shí)驗(yàn)來(lái)提供統(tǒng)計(jì)***性,以克服泊松分布的限制。
文章來(lái)源地址: http://www.cdcfah.com/cp/213392.html
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