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詳細(xì)說明
熒光定量PCR實驗步驟:
取凍存已裂解的細(xì)胞,室溫放置5分鐘使其完全溶解。
兩相分離 每1ml的TRIZOL試劑裂解的樣品中加入0.2ml的lvfang,蓋緊管蓋。手動劇烈振蕩管體15秒后,15到30℃孵育2到3分鐘。4℃下12000rpm離心15分鐘。離心后混合液體將分為下層的紅色酚lvfang相,中間層以及無色水相上層。RNA全部被分配于水相中。水相上層的體積大約是勻漿時加入的TRIZOL試劑的60%,北京臨床疾病熒光定量PCR分析服務(wù)。
RNA沉淀 將水相上層轉(zhuǎn)移到一干凈無RNA酶的離心管中。加等體積異丙醇混合以沉淀其中的RNA,北京臨床疾病熒光定量PCR分析服務(wù),北京臨床疾病熒光定量PCR分析服務(wù),混勻后15到30℃孵育10分鐘后,于4℃下12000rpm 離心10分鐘。此時離心前不可見的RNA沉淀將在管底部和側(cè)壁上形成膠狀沉淀塊。
TaqMan探針法:TaqMan 探針法是具有高度特異性的定量 PCR 技術(shù)。它的工作原理是在 PCR 反應(yīng)體系中存在一對 PCR 引物和一條探針,探針的5′ 端標(biāo)記有報告基團(tuán),3′ 端標(biāo)記有熒光淬滅基團(tuán),探針只與模板特異結(jié)合,其結(jié)合位點在兩條引物之間。當(dāng)探針完整的時候,報告基團(tuán)的熒光能量被淬滅基團(tuán)吸收,所以儀器搜集不到信號,隨著反應(yīng)的進(jìn)展,Taq酶遇到探針,利用 3′→5′ 外切核酸酶的活性把探針切斷,導(dǎo)致報告基團(tuán)的熒光能量不能被淬滅基團(tuán)吸收,產(chǎn)生了熒光信號,因此信號的強(qiáng)度就**了模板 DNA 的拷貝數(shù)
為了正確地評估 PCR 效率,至少需要 3 次重復(fù)和至少 5 個數(shù)量級倍數(shù)的模板濃度。圖 6 說了建議此精確級別的理由,它證明在 1 個數(shù)量級倍數(shù)與 5 個數(shù)量級倍數(shù)范圍內(nèi)測試稀釋模板時,獲得的斜率或效率可能產(chǎn)生數(shù)學(xué)偏差。因此,即使檢測 ** 有效,由于每個稀釋點都存在標(biāo)準(zhǔn)差,檢測一個數(shù)量級倍數(shù)的連續(xù)稀釋時,可能獲得 70 至 170% 的范圍。在 5 個數(shù)量級倍數(shù)范圍內(nèi)做相同數(shù)量的稀釋點或重復(fù),可能的偏移只有 ±8%。這意味著在 5 個數(shù)量級倍數(shù)范圍內(nèi),如果效率為 94%,則該實驗的效率范圍介于 88% 到 ** 之間。為了準(zhǔn)確測定 PCR 反應(yīng)的效率,必須進(jìn)行 5 個數(shù)量級倍數(shù)的連續(xù)稀釋。-3.3 ±10% 的斜率意味著效率達(dá)到 ** ±±10%。PCR 反應(yīng)效率越低,那么靈敏度越低。
文章來源地址: http://www.cdcfah.com/cp/225167.html
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