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為什么發(fā)現(xiàn)病例的要盡快對(duì)病毒進(jìn)行全基因組測(cè)序呢?通過(guò)對(duì)病毒全基因組高通量測(cè)序可以在較短時(shí)間內(nèi)獲取病毒的全部基因信息,解釋病毒的來(lái)源、傳播,DNA全基因組病毒分析方法、變異演化等科學(xué)問(wèn)題,為后續(xù)流行病學(xué)調(diào)查指明方向,為相關(guān)病例的追蹤溯源提供重要依據(jù),目前對(duì)溯源分型主要檢測(cè)手段就是高通量測(cè)序技術(shù),DNA全基因組病毒分析方法。高通量測(cè)序技術(shù)如何進(jìn)行病毒溯源?先對(duì)獲得的早期病例標(biāo)本開(kāi)展全基因組高通量序列測(cè)定,通過(guò)與本地流行病毒及全球其他地區(qū)測(cè)定過(guò)序列的病毒比較,如果該病例傳染的病毒在基因組上和北美流行株更接近,比如在全長(zhǎng)接近3萬(wàn)個(gè)堿基的序列上,兩者*相差幾個(gè)堿基,相似度為99%以上,DNA全基因組病毒分析方法,這就是為我們推斷該病例攜帶病毒為北美流行株提供依據(jù)。全基因組測(cè)序通過(guò)運(yùn)用新一代高通量DNA測(cè)序儀,進(jìn)行10到20倍覆蓋率的個(gè)人全基因組測(cè)序。DNA全基因組病毒分析方法
上海探普生物科技有限公司的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序有什么優(yōu)勢(shì)?全國(guó)開(kāi)設(shè)病毒相關(guān)測(cè)序的公司不超過(guò)5家,只有探普生物是專(zhuān)門(mén)為病毒研究者服務(wù)的,探普生物的研發(fā)團(tuán)隊(duì)和實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)都來(lái)自全國(guó)各地病毒學(xué)、微生物學(xué)專(zhuān)業(yè)的高校,碩士及以上學(xué)歷成員超過(guò)60%,團(tuán)隊(duì)具備普通測(cè)序?qū)嶒?yàn)和分析基礎(chǔ)之外,同時(shí)具備病毒學(xué)及微生物學(xué)的學(xué)術(shù)背景,相當(dāng)了解病毒相關(guān)樣本情況、研究方向等。研究者在項(xiàng)目咨詢的時(shí)候就可以明顯感覺(jué)到探普生物的專(zhuān)業(yè)性,溝通順暢,省時(shí)省力。國(guó)內(nèi)全基因組分析技術(shù)探普生物病毒基因組測(cè)序的流程有:與銷(xiāo)售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況。
為了便于新發(fā)或罕見(jiàn)病毒性傳染病的篩查檢測(cè),利用多重置換擴(kuò)增技術(shù),以負(fù)鏈RNA病毒—發(fā)熱伴血小板減少綜合征病毒和正鏈RNA病毒—登革病毒為模擬樣本探索臨床樣本中RNA病毒基因組非特異性擴(kuò)增方法。研究中通過(guò)梯度稀釋的RNA病毒模擬樣本中可能存在的不同豐度的病原體,樣本核酸依次加工成單鏈cDNA,雙鏈cDNA,T4DNA連接酶處理后的雙鏈cDNA以及添加外源輔助RNA后合成并連接的雙鏈cDNA形式,然后進(jìn)行Phi29DNA聚合酶等溫?cái)U(kuò)增,使用熒光定量PCR方法比較各種方法對(duì)RNA病毒核酸擴(kuò)增的影響。
在哪些應(yīng)用場(chǎng)景需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序?在探普生物長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)行過(guò)程中,我們接觸到的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場(chǎng)景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測(cè)序。這種場(chǎng)景一般是用密集的sanger測(cè)序監(jiān)測(cè)某幾個(gè)關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測(cè)序。這樣的組合省時(shí)省力省經(jīng)費(fèi),同時(shí)能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對(duì)傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測(cè)和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測(cè)疫病的目的。二代測(cè)序用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序有哪些挑戰(zhàn)?
對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序時(shí),生物信息學(xué)分析是如何進(jìn)行的?生存環(huán)境和狀態(tài)決定了對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點(diǎn),優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫(kù),搭載了**的生物信息學(xué)分析流程,可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。探普生物基于該特點(diǎn),優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫(kù),專(zhuān)門(mén)搭載了生物信息學(xué)分析流程,可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。生物信息學(xué)流程主要包括對(duì)非目標(biāo)數(shù)據(jù)進(jìn)行去除以及對(duì)目標(biāo)序列進(jìn)行篩選,高質(zhì)量高完整度的序列拼接以及后續(xù)的高級(jí)分析,如SNP分析,進(jìn)化分析,耐藥位點(diǎn)分析等。在探普的**流程下,可以獲得完整性很高的基因組序列。在探普生物進(jìn)行病毒基因組測(cè)序的流程是怎么樣的?DNA全基因組病毒分析方法
關(guān)于未培養(yǎng)病毒基因組標(biāo)準(zhǔn)的信息是在基因組標(biāo)準(zhǔn)框架內(nèi)制定的。DNA全基因組病毒分析方法
在探普生物進(jìn)行病毒基因組測(cè)序的流程是怎么樣的?在探普生物進(jìn)行病毒基因組測(cè)序非常簡(jiǎn)單,簡(jiǎn)而言之,客戶只需要說(shuō)清楚樣品情況,準(zhǔn)備樣品即可,其他事宜都由探普來(lái)進(jìn)行安排。大致流程如下:1)與銷(xiāo)售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況;2)探普生物工作人員擬定項(xiàng)目合同,雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章;3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備好樣本,填寫(xiě)信息單后通知銷(xiāo)售人員預(yù)訂干冰,安排樣本寄運(yùn)輸;4)客戶支付項(xiàng)目啟動(dòng)款,探普生物啟動(dòng)項(xiàng)目實(shí)驗(yàn)和分析并提供測(cè)序報(bào)告;5)客戶支付項(xiàng)目尾款,探普生物提交測(cè)序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果;6)售后問(wèn)題處理,項(xiàng)目結(jié)題。DNA全基因組病毒分析方法
上海探普生物科技有限公司專(zhuān)注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā),發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大。一批專(zhuān)業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì),是實(shí)現(xiàn)企業(yè)戰(zhàn)略目標(biāo)的基礎(chǔ),是企業(yè)持續(xù)發(fā)展的動(dòng)力。公司以誠(chéng)信為本,業(yè)務(wù)領(lǐng)域涵蓋病毒測(cè)序,病毒全基因組測(cè)序,病毒宏基因組測(cè)序,未知病原鑒定,我們本著對(duì)客戶負(fù)責(zé),對(duì)員工負(fù)責(zé),更是對(duì)公司發(fā)展負(fù)責(zé)的態(tài)度,爭(zhēng)取做到讓每位客戶滿意。一直以來(lái)公司堅(jiān)持以客戶為中心、病毒測(cè)序,病毒全基因組測(cè)序,病毒宏基因組測(cè)序,未知病原鑒定市場(chǎng)為導(dǎo)向,重信譽(yù),保質(zhì)量,想客戶之所想,急用戶之所急,全力以赴滿足客戶的一切需要。
文章來(lái)源地址: http://www.cdcfah.com/cp/2832562.html
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