近年來(lái)，隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，對(duì)微生物群（微生物組）的研究逐漸加深，研究熱點(diǎn)越來(lái)越多集中于環(huán)境和生物體相互作用的微生物群，鄭州宏病毒組測(cè)序分析服務(wù)。加之測(cè)序成本降低，分析技術(shù)不斷提升，都使得宏基因組測(cè)序技術(shù)得到普遍應(yīng)用。為什么要做宏基因組：宏基因組相對(duì)16S來(lái)說(shuō)其物種分辨率會(huì)更高，鄭州宏病毒組測(cè)序分析服務(wù)，隨著物種測(cè)序完成越來(lái)越多，數(shù)據(jù)庫(kù)更加完善，在腸道菌群方面基本能實(shí)現(xiàn)97%以上的菌都能鑒定到種，90%以上到菌株層面，鄭州宏病毒組測(cè)序分析服務(wù)。而且可以同時(shí)獲得除RNA病毒外的所有物種的分布。此外包括菌基因組CNV等方法的出現(xiàn)，可以直接通過(guò)大規(guī)模宏基因組測(cè)序不僅找到可能的菌，進(jìn)一步還能鑒定出特定候選基因區(qū)段?；贜GS的宏基因組學(xué)檢測(cè)技術(shù)在2014年被用于臨床傳染患者的病原學(xué)診斷。鄭州宏病毒組測(cè)序分析服務(wù)

目前，構(gòu)建的病毒宏基因組學(xué)文庫(kù)主要有載體克隆文庫(kù)和基于高通量測(cè)序技術(shù)的加接頭的文庫(kù)。隨著深度測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展，第二代高通量測(cè)序技術(shù)、第三代單分子測(cè)序技術(shù)已經(jīng)普遍地應(yīng)用于各項(xiàng)研究領(lǐng)域中，以454測(cè)序技術(shù)和Illumina測(cè)序技術(shù)為表示的二代測(cè)序法得到迅速推廣用于構(gòu)建病毒宏基因組文庫(kù)，相信將來(lái)第三代測(cè)序平臺(tái)如tSMSTM（truesinglemolecularsequeneing）技術(shù)平臺(tái)、SMRT（singlemoleculereal-time）技術(shù)平臺(tái)、FRET測(cè)序技術(shù)及納米孔單分子技術(shù)為表示的第三代測(cè)序法也將應(yīng)用于構(gòu)建病毒宏基因組文庫(kù)。Donaldson等[23]采用高通量測(cè)序技術(shù)構(gòu)建了蝙蝠腸道的病毒宏基因組學(xué)文庫(kù)，獲得了600000條讀長(zhǎng)（Reads）的核酸序列。鄭州宏病毒組測(cè)序分析服務(wù)病毒宏基因組學(xué)是宏基因組學(xué)的一個(gè)分支，指研究特定環(huán)境中的病毒群落的一門(mén)技術(shù)。

基因測(cè)序技術(shù)在此次**中起到了至關(guān)重要的作用，我國(guó)科研單位在一個(gè)月之內(nèi)迅速發(fā)現(xiàn)了正確的致病病毒并完成測(cè)序，得到了WHO的贊許。我國(guó)科學(xué)研究者對(duì)病毒序列、變異、核酸檢測(cè)手段的分享也為全世界應(yīng)對(duì)COVID-19**帶來(lái)了極有力的支持。在病毒檢測(cè)過(guò)程中，一種測(cè)序技術(shù)獲得了市場(chǎng)的普遍關(guān)注，這個(gè)技術(shù)就是宏基因組測(cè)序（mNGS）技術(shù)。宏基因組學(xué)（Metagenomics），是以特定環(huán)境樣品中整個(gè)微生物群落基因組作為研究對(duì)象，無(wú)需分離培養(yǎng)，直接提取環(huán)境樣本的DNA進(jìn)行高通量測(cè)序。對(duì)于臨床而言，mNGS可以準(zhǔn)確的分析患者樣本全部微生物，這一點(diǎn)對(duì)于傳染性疾病的病原體研究具有極高的應(yīng)用價(jià)值。

宏病毒組其實(shí)就是病毒的宏基因組（meta-genomics），該技術(shù)是隨著高通量測(cè)序技術(shù)的興起而發(fā)展起來(lái)的。該技術(shù)主要是使用大量微生物群體樣本的測(cè)序數(shù)據(jù)和生物信息學(xué)分析手段，以多種數(shù)據(jù)庫(kù)為基礎(chǔ)，進(jìn)行群體的種類(lèi)和功能分析。因此，它主要的應(yīng)用場(chǎng)景在于微生物群體研究，如腸道微生物、皮膚微生物、口腔微生物、水體微生物、土壤微生物等。一直以來(lái)宏基因組技術(shù)都是在細(xì)菌領(lǐng)域使用，病毒的樣本收集困難、文庫(kù)構(gòu)建繁瑣、數(shù)據(jù)庫(kù)不完善，因此宏基因組技術(shù)未能獲得普遍應(yīng)用。上海探普生物科技有限公司立志專(zhuān)門(mén)解決病毒方向的基因組研究難題，開(kāi)發(fā)了整套的樣本處理和生信分析流程，基于這套流程，研究者們想對(duì)樣本進(jìn)行宏病毒組測(cè)序就很容易實(shí)現(xiàn)了。在探普生物進(jìn)行病毒宏基因組測(cè)序，基于探普的專(zhuān)有流程，樣本要求非常低。

**狀病毒的發(fā)現(xiàn)，病原宏基因組測(cè)序功不可沒(méi)：對(duì)一種新病毒進(jìn)行鑒定和檢測(cè)，其中非常關(guān)鍵的步驟就是獲得病毒的全基因組信息。在此次**監(jiān)測(cè)和防控中，病原宏基因組測(cè)序發(fā)揮了至關(guān)重要的作用，利用其技術(shù)優(yōu)勢(shì)，研究人員在五天內(nèi)就鑒定并分析出的基因組，而2003年SARS的鑒定耗時(shí)5月余、2013年H7N9的鑒定耗時(shí)1月余。2019-nCoV為線性單鏈RNA（ssRNA）病毒，基因組全長(zhǎng)包含29903個(gè)核苷酸，10個(gè)基因。病毒基因組序列為進(jìn)一步分析其傳染機(jī)理，傳播途徑，藥物靶點(diǎn)等提供了有利的支持。病毒宏基因組測(cè)序：可直接對(duì)樣本中的核酸進(jìn)行高通量測(cè)序。深圳水體微生物測(cè)序分析

全國(guó)開(kāi)設(shè)病毒宏基因組測(cè)序的公司不超過(guò)3家，只有探普生物是專(zhuān)門(mén)為病毒研究者服務(wù)的。鄭州宏病毒組測(cè)序分析服務(wù)

病毒宏基因組學(xué)文庫(kù)中包含兆級(jí)的短序列片段（Reads）。通過(guò)不同的序列拼接軟件將Reads拼接較長(zhǎng)的DNA序列片斷（Contigs）。數(shù)據(jù)組裝可通過(guò)K-mer分析評(píng)估各個(gè)樣品的測(cè)序深度，通過(guò)對(duì)SOAPdenovo設(shè)置不同K值，篩選較好組裝結(jié)果，對(duì)較好組裝結(jié)果進(jìn)行校正，并統(tǒng)計(jì)Reads利用率。接著利用已測(cè)序生物體的DNA序列構(gòu)建數(shù)據(jù)庫(kù)，將拼接后的Contigs通過(guò)不同的鑒定方案，與數(shù)據(jù)庫(kù)里的DNA序列信息進(jìn)行比對(duì)，確定該序列來(lái)自的生物群落，篩選有用的基因信息。此外，還可以用一些工具對(duì)序列進(jìn)行基因預(yù)測(cè)（如Metagene、GeneMark、FragGeneScan等）。鄭州宏病毒組測(cè)序分析服務(wù)

上海探普生物科技有限公司專(zhuān)注技術(shù)創(chuàng)新和產(chǎn)品研發(fā)，發(fā)展規(guī)模團(tuán)隊(duì)不斷壯大。目前我公司在職員工以90后為主，是一個(gè)有活力有能力有創(chuàng)新精神的團(tuán)隊(duì)。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括：病毒測(cè)序，病毒全基因組測(cè)序，病毒宏基因組測(cè)序，未知病原鑒定等。公司奉行顧客至上、質(zhì)量為本的經(jīng)營(yíng)宗旨，深受客戶好評(píng)。公司憑著雄厚的技術(shù)力量、飽滿的工作態(tài)度、扎實(shí)的工作作風(fēng)、良好的職業(yè)道德，樹(shù)立了良好的病毒測(cè)序，病毒全基因組測(cè)序，病毒宏基因組測(cè)序，未知病原鑒定形象，贏得了社會(huì)各界的信任和認(rèn)可。

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