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上海探普生物科技有限公司對(duì)樣本進(jìn)行宏病毒組測(cè)序有什么優(yōu)勢(shì)?全國(guó)開(kāi)設(shè)病毒宏基因組測(cè)序的公司不超過(guò)3家,只有探普生物是專(zhuān)門(mén)為病毒研究者服務(wù)的,探普生物的研發(fā)團(tuán)隊(duì)和實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)都來(lái)自全國(guó)各地病毒學(xué)、微生物學(xué)專(zhuān)業(yè)的高校,碩士及以上學(xué)歷成員超過(guò)60%,團(tuán)隊(duì)具備普通測(cè)序?qū)嶒?yàn)和分析基礎(chǔ)之外,同時(shí)具備病毒學(xué)及微生物學(xué)的學(xué)術(shù)背景,相當(dāng)了解病毒相關(guān)樣本情況、研究方向等。研究者在項(xiàng)目咨詢(xún)的時(shí)候就可以明顯感覺(jué)到探普生物的專(zhuān)業(yè)性,鄭州宏基因?qū)W分析,溝通順暢,省時(shí)省力,鄭州宏基因?qū)W分析,鄭州宏基因?qū)W分析。通過(guò)對(duì)樣本進(jìn)行宏病毒組測(cè)序,我們可以了解單個(gè)樣本里有什么病毒,相對(duì)含量是多少,優(yōu)勢(shì)物種是什么。鄭州宏基因?qū)W分析
目前,構(gòu)建的病毒宏基因組學(xué)文庫(kù)主要有載體克隆文庫(kù)和基于高通量測(cè)序技術(shù)的加接頭的文庫(kù)。隨著深度測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展,第二代高通量測(cè)序技術(shù)、第三代單分子測(cè)序技術(shù)已經(jīng)普遍地應(yīng)用于各項(xiàng)研究領(lǐng)域中,以454測(cè)序技術(shù)和Illumina測(cè)序技術(shù)為表示的二代測(cè)序法得到迅速推廣用于構(gòu)建病毒宏基因組文庫(kù),相信將來(lái)第三代測(cè)序平臺(tái)如tSMSTM(truesinglemolecularsequeneing)技術(shù)平臺(tái)、SMRT(singlemoleculereal-time)技術(shù)平臺(tái)、FRET測(cè)序技術(shù)及納米孔單分子技術(shù)為表示的第三代測(cè)序法也將應(yīng)用于構(gòu)建病毒宏基因組文庫(kù)。Donaldson等[23]采用高通量測(cè)序技術(shù)構(gòu)建了蝙蝠腸道的病毒宏基因組學(xué)文庫(kù),獲得了600000條讀長(zhǎng)(Reads)的核酸序列??谇晃⑸锓治錾夏恼疑虾L狡丈锟萍加邢薰緦?duì)樣本進(jìn)行宏病毒組測(cè)序有什么優(yōu)勢(shì)?
宏基因組測(cè)序:宏基因組測(cè)序是對(duì)人體樣本或特定環(huán)境樣品中的總核酸(DNA或RNA)進(jìn)行高通量測(cè)序,通過(guò)比對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù),得到傳染病原體的信息,能夠檢測(cè)出新發(fā)和罕見(jiàn)病原體,特別是在未知病原檢測(cè)中發(fā)揮了難以替代的作用,當(dāng)然宏基因組檢測(cè)方法也面臨不少挑戰(zhàn),檢測(cè)結(jié)果的靈敏度受宿主及其他微生物背景核酸的影響。高通量測(cè)序技術(shù)能夠提供準(zhǔn)確而科學(xué)的基因測(cè)序分析結(jié)果,為**防控提供有力技術(shù)保障??茖W(xué)家通過(guò)對(duì)病毒進(jìn)行全基因組測(cè)序,可以了解不同傳播階段的變異情況,推測(cè)病毒對(duì)人的傳染力的變化及傳播情況。
近年來(lái),隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,對(duì)微生物群(微生物組)的研究逐漸加深,研究熱點(diǎn)越來(lái)越多集中于環(huán)境和生物體相互作用的微生物群。加之測(cè)序成本降低,分析技術(shù)不斷提升,都使得宏基因組測(cè)序技術(shù)得到普遍應(yīng)用。為什么要做宏基因組:宏基因組相對(duì)16S來(lái)說(shuō)其物種分辨率會(huì)更高,隨著物種測(cè)序完成越來(lái)越多,數(shù)據(jù)庫(kù)更加完善,在腸道菌群方面基本能實(shí)現(xiàn)97%以上的菌都能鑒定到種,90%以上到菌株層面。而且可以同時(shí)獲得除RNA病毒外的所有物種的分布。此外包括菌基因組CNV等方法的出現(xiàn),可以直接通過(guò)大規(guī)模宏基因組測(cè)序不*找到可能的菌,進(jìn)一步還能鑒定出特定候選基因區(qū)段。宏基因組測(cè)序?yàn)檠芯亢烷_(kāi)發(fā)利用占微生物種類(lèi)99%以上的未可培養(yǎng)的微生物提供了一種新的途徑和良好的策略。
一直以來(lái)宏基因組技術(shù)都是在細(xì)菌領(lǐng)域使用,病毒的樣本收集困難、文庫(kù)構(gòu)建繁瑣、數(shù)據(jù)庫(kù)不完善,因此宏基因組技術(shù)未能獲得普遍應(yīng)用。生物進(jìn)行病毒宏基因組測(cè)序,樣品具備什么條件才可以獲得比較質(zhì)量的宏基因組分析效果?其他公司對(duì)用于測(cè)序的樣本的要求較高。而在探普生物進(jìn)行病毒宏基因組測(cè)序,基于探普的專(zhuān)有流程,樣本要求非常低,不要求總量到達(dá)微克,探普有專(zhuān)門(mén)的收樣標(biāo)準(zhǔn)和送樣流程。為了保證后續(xù)數(shù)據(jù)的有效利用率,需要客戶(hù)配合完成合格的取樣步驟和樣本前處理步驟。當(dāng)然探普也提供適當(dāng)?shù)臉颖咎幚矸?wù)。核酸性質(zhì)有RNA和DNA之分,核酸鏈還有單雙鏈之分,而核酸本質(zhì)不同和單雙鏈的不同,進(jìn)行同樣的實(shí)驗(yàn)步驟其效率也不一樣。病毒宏基因組測(cè)序:可直接對(duì)樣本中的核酸進(jìn)行高通量測(cè)序??谇晃⑸锓治錾夏恼?/p>
病毒宏基因組測(cè)序在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專(zhuān)門(mén)針對(duì)病毒的核酸純化樣本指南,以提高純度和得率。鄭州宏基因?qū)W分析
宏基因組有廣義和狹義兩種概念。廣義的概念是指所有可能與人的生活密切相關(guān)的微生物的基因組,包括長(zhǎng)期共生在體內(nèi)的微生物,也包括可以進(jìn)入體內(nèi),對(duì)人類(lèi)的生活造成不同形式的影響的微生物。而狹義的宏基因組是*指長(zhǎng)期共生在體內(nèi)的微生物。宏基因組測(cè)序分析技術(shù):?jiǎn)问枪采谌梭w內(nèi)的微生物就有1000多種,特別是胃腸道內(nèi)的微生物為豐富。宏基因組除了這些微生物外,也包括以其他方式偶爾進(jìn)入人體內(nèi)的微生物,這些微生物可能形成病源體,影響我們的健康?,F(xiàn)在科學(xué)家可以分析和發(fā)現(xiàn)引起疾病的異常微生物存在與活動(dòng),從而保護(hù)人體的健康。鄭州宏基因?qū)W分析
上海探普生物科技有限公司是一家 從事生物科技專(zhuān)業(yè)領(lǐng)域內(nèi)技術(shù)開(kāi)發(fā)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢(xún)、技術(shù)服務(wù),化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、煙花爆竹、民用物品、易制毒化學(xué)品),實(shí)驗(yàn)室設(shè)備,計(jì)算機(jī)、軟件及輔助設(shè)備,電子產(chǎn)品銷(xiāo)售,計(jì)算機(jī)軟件開(kāi)發(fā)及維護(hù),計(jì)算機(jī)信息系統(tǒng)集成服務(wù)等。的公司,是一家集研發(fā)、設(shè)計(jì)、生產(chǎn)和銷(xiāo)售為一體的專(zhuān)業(yè)化公司。上海探普生物作為 從事生物科技專(zhuān)業(yè)領(lǐng)域內(nèi)技術(shù)開(kāi)發(fā)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢(xún)、技術(shù)服務(wù),化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、煙花爆竹、民用物品、易制毒化學(xué)品),實(shí)驗(yàn)室設(shè)備,計(jì)算機(jī)、軟件及輔助設(shè)備,電子產(chǎn)品銷(xiāo)售,計(jì)算機(jī)軟件開(kāi)發(fā)及維護(hù),計(jì)算機(jī)信息系統(tǒng)集成服務(wù)等。的企業(yè)之一,為客戶(hù)提供良好的病毒測(cè)序,病毒全基因組測(cè)序,病毒宏基因組測(cè)序,未知病原鑒定。上海探普生物不斷開(kāi)拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺(tái),以應(yīng)用為重點(diǎn),以服務(wù)為保證,不斷為客戶(hù)創(chuàng)造更高價(jià)值,提供更優(yōu)服務(wù)。上海探普生物創(chuàng)始人喻利,始終關(guān)注客戶(hù),創(chuàng)新科技,竭誠(chéng)為客戶(hù)提供良好的服務(wù)。
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